Am 21. November wurde Tonio Borg zum EU-Kommissar für Gesundheit und Konsumentenpolitik gewählt. Die Wahl erfolgte mit 386 Ja gegen 281 Nein bei 28 Enthaltungen. Tonio Borg übte dieses Amt nach dem Rücktritt von John Dalli am 16. Oktober 2012 interimistisch aus. Dieser war in eine Korruptionsaffäre rund um die Tabakindustrie verwickelt gewesen.

Mitglieder des Europäischen Parlaments sprachen Tonio Borg auf das Verbot von Tierversuchen ab 2013 für Kosmetika an, welcher sich am 13. November dieses Jahres klar für ein Einhalten des Verbots äusserte. Ohne Zwang werde die Industrie nicht die notwendigen Bemühungen unternehmen, um Alternativmethoden zu entwickeln, welche die drei letzten noch bewilligten Toxizitäts-Tests an Tieren ersetzen sollen.
Darüber hinaus versicherte Tonio Borg, wenn er zum EU-Kommissar für Gesundheit und Konsumentenpolitik gewählt werde, wolle er am Termin 2013 zur Einstellung der Tests festhalten.